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Universidad Internacional Men?ez Pelayo. Página principal
Ficha de la asignatura
MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOLOGÍA SINTÉTICA INTEGRATIVA
Métodos avanzados en Biología Sintética Integrativa

DESCRIPCIÓN DE LA ASIGNATURA

Descripción no definida

DURACIÓN

Cuatrimestral

CRÉDITOS DE LA ASIGNATURA

Créditos ECTS: 10

PROFESOR RESPONSABLE

Buceta Fernández, Javier
Doctor C.C. Físicas
Cientifico Titular CSIC/Investigador Principal
Instituto de Biología Integrativa de Sistemas

Durante Rodríguez, Gonzalo
Científico Postdoctoral (Microbiología Medioambiental y Molecular)
Centro de Investigaciones Biológicas - CSIC

Monterroso Marco, Begoña
Doctora en Farmacia
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Zorrilla López, Silvia
Científico Titular
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

PROFESORADO

Albert de la Cruz, Armando Joaquín
Investigador Científico
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQFR)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Alfonso Botello, Carlos
Científico Titular
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Arias Palomo, Ernesto
Doctor en Bioquímica y Biología Molecular
Científico Titulas de los OPIS
Centro de Investigaciones Biológicas Margarita Salas (CSIC)

Barriuso Maicas, Jorge
Doctor en Biotecnología
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Blanco Gutiérrez, Francisco José
Doctor en Ciencias Químicas
Investigador científico del CSIC
Centro de Investigaciones Biológicas Margarita Salas

Cañada Vicinay, Francisco Javier
Profesor de Investigación
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Carbonell Cortés, Pablo
Doctor Ingeniero Industrial
Profesor Titular de Universidad
Universidad Politécnica de Valencia

Conesa Muñoz, José Javier
Doctor en Biología Molecular y Celular
Posdoctoral
CNB-CSIC

Escolar Antúnez, Fernando
Especialista I+D+I
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Fernández Fernández, Cristina
Doctora en Biología Molecular/ Técnico especializado OPIS
Ingeniera Química
Instituto de Biología Integrativa de Sistemas - I2SYSBIO

Fernández Pérez, Francisco José
Doctor en Bioquímica y Biología Molecular
Director Ejecutivo de Abvance Biotech

Fernández Tornero, Carlos
Investigador Científico
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

González Ibáñez, Carlos
Profesor de Investigación
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQFR)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

González Pérez, Beatriz
Científico Titular
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQFR)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Goñi Moreno, Ángel
Doctor en Ingeniería Informática
Investigador
Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas
Universidad Politécnica de Madrid

Hermoso Domínguez, Juan Antonio
Investigador Científico
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQF)
Centro Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Infantes San Mateo, Lourdes
Científico Titular
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQFR)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Jaramillo Rosales, Alfonso
Doctor en Física
Investigador Científico
Centro Superior de Investigaciones Científicas CSIC

Lietha , Daniel
Investigador Distinguido
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Biológicas (CSIC)

Luque Ortega, Juan Román
Doctor en Biología
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Mancheño Gómez, Jose Miguel
Científico Titular
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQFR)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Martín Santamaría, Sonsoles
Investigadora científica.
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Mompeán García, Miguel Ángel
Investigador Posdoctoral
IQF Blas Cabrera CSIC (Madrid)

Nogales Enrique, Juan
Científico Titular (Group Leader of Systems Biotechnology Group)
Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC)

Nollmann Martínez, Marcelo
Doctor
Biofísica
Centre Nationale de la Recherche Scientifique (CNRS)

Núñez Ramírez, Rafael
Técnico Superior Especializado
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Oroz Garde, Francisco Javier
Investigador Postdoctoral
Instituto de Química Física Rocasolano (IQFR)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Otero Muras, Irene
Doctora en Ingeniería Química (Universidad de Vigo)
Científica Titular CSIC
Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (UV-CSIC)

Pazos Cabaleiro, Florencio
Doctor en Ciencias
Científico Titular OPIS
Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC)

Peñalva Soto, Miguel Ángel
Profesor de Investigación
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Biológicas (CSIC)

Pérez Cañadillas, José Manuel
Cientifico Titular
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQFR)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Pérez Fernández, Ruth
Científico Titular
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Sanz Aparicio, Juliana
Doctora Ciencia Químicas
Investigadora Científica CSIC
Instituto de Química-Física Rocasolano (IQFR).
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Tamames de la Huerta, Javier
Doctor en Ciencias
Científico Titular
CNB-CSIC

Urchueguía Fornes, Arantxa
Doctorado en Biología de Sistemas
Investigadora postdoctoral: biología sintética
Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2sysbio)

Vega Fernández, María Cristina
Científico Titular
Centro de Investigaciones Biológicas (CIB)
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)






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Martes, 07 de Noviembre de 2023

10:00 - 11:00

Fundamentals of protein production toolstemaaaa

11:00 - 12:00

Membrane protein productiontemaaaa
Daniel Lietha
12:00 - 13:00

Antibody production in cell-free systemstemaaaa

15:00 - 16:00

In vitro reconstitution of cell mimicking systemstemaaaa

Miércoles, 08 de Noviembre de 2023

10:00 - 11:00

Fundamentals of X-ray Crystallography: from molecules to crystals and beyondtemaaaa

11:00 - 11:30

Membrane Maintenance at Contact Sitestemaaaa

11:30 - 12:00

PENDIENTEtemaaaa

12:30 - 13:00

Glyco-Synthetic Biologytemaaaa
Juliana Sanz Aparicio
13:00 - 13:30

Conformational Versatility in Protein Complexestemaaaa

15:00 - 16:00

Practical session: Crystallization, data collection and structure solutiontemaaaa
Lourdes Infantes San Mateo
16:00 - 17:00

Practical session: Crystallization, data collection and structure solutiontemaaaa

Lunes, 13 de Noviembre de 2023

10:00 - 11:00

Fundamentalstemaaaa

11:15 - 12:15

Applicationstemaaaa

12:30 - 13:30

Practical casestemaaaa

15:00 - 17:00

Chemical biology tools - chemical systems and probestemaaaa

Martes, 14 de Noviembre de 2023

10:00 - 11:00

NMR - fundamentalstemaaaa

11:00 - 11:30

NMR - Nucleic acidstemaaaa

11:30 - 12:00

NMR - Proteinstemaaaa

12:30 - 13:00

NMR - Protein supramolecular assembliestemaaaa
Francisco Javier Oroz Garde
13:00 - 13:30

NMR - Advanced NMR toolstemaaaa

Investigador Posdoctoral
IQF Blas Cabrera CSIC (Madrid)
16:00 - 17:00

NMR - practical sessiontemaaaa

Miércoles, 15 de Noviembre de 2023

10:00 - 11:00

EM - fundamentalstemaaaa
Ernesto Arias Palomo
11:15 - 12:15

EM - reconstructing cellular machines (1)temaaaa

15:30 - 16:30

EM - reconstructing cellular machines (2)temaaaa

16:30 - 17:00

EM - practical workshoptemaaaa

Lunes, 20 de Noviembre de 2023

10:00 - 10:30

EM - practical workshoptemaaaa

10:30 - 11:00

EM - practical workshoptemaaaa

Martes, 21 de Noviembre de 2023

10:00 - 10:30

AUC, light scatteringtemaaaa

10:00 - 11:00

AUC, light scatteringtemaaaa
Carlos Alfonso Botello
11:15 - 12:15

Fluorescence spectroscopytemaaaa

12:30 - 13:30

Calorimetry (ITC, DSC), circular dichroismtemaaaa

15:00 - 16:00

Molecular interactions - practical workshoptemaaaa
Carlos Alfonso Botello
16:00 - 17:00

Molecular interactions - practical workshoptemaaaa

Miércoles, 22 de Noviembre de 2023

10:00 - 12:00

Confocal and multi-D microscopytemaaaa

15:00 - 17:00

Single-molecule and super-resolution tools (ONLINE)temaaaa

Jueves, 23 de Noviembre de 2023

10:00 - 11:00

Microdroplets in microfluidicstemaaaa

11:15 - 12:15

Microfluidics - Practical sessiontemaaaa

12:30 - 13:30

Fluorescence - Practical sessiontemaaaa

Martes, 23 de Enero de 2024

10:00 - 11:00

I) From gene regulatory networks to metabolic pathways. An introduction to biocircuits (ONLINE)temaaaa
Irene Otero Muras
11:15 - 12:15

II) An introduction to dynamic modeling in systems and synthetic biology (ONLINE)temaaaa
Irene Otero Muras
12:30 - 13:30

(III) Making a genetic toggle switch (ONLINE)temaaaa
Irene Otero Muras
Miércoles, 24 de Enero de 2024

10:00 - 11:00

PENDIENTE (ONLINE)temaaaa

11:15 - 12:15

PENDIENTE (ONLINE)temaaaa

Martes, 30 de Enero de 2024

10:00 - 11:00

(I): Introduction, parts, systems and devices (ONLINE)temaaaa
Irene Otero Muras
11:15 - 12:15

temaaaa
Irene Otero Muras
12:30 - 13:30

(III): Optimization and control of biocircuits (ONLINE)temaaaa
Irene Otero Muras
Miércoles, 31 de Enero de 2024

10:00 - 11:00

(IV): Feed-forward motifs (ONLINE)temaaaa

11:15 - 12:15

(V): The role of noise (ONLINE)temaaaa

12:30 - 13:30

VI): PENDIENTE (ONLINE)temaaaa

Martes, 06 de Febrero de 2024

10:00 - 11:00

Introduction to Metabolic Network Analysis (ONLINE)temaaaa

11:15 - 12:15

Computational Protein Design (ONLINE)temaaaa

12:30 - 13:30

Metabolic Pathway Design (ONLINE)temaaaa

Miércoles, 07 de Febrero de 2024

10:00 - 11:00

Examples of de novo RNA sequences with targeted function (riboregulators, de novo ribozymes, etc) (ONLINE)temaaaa
Alfonso Jaramillo Rosales
11:15 - 12:15

Computational and experimental design of de novo RNA sequences with targeted function (ONLINE)temaaaa
Alfonso Jaramillo Rosales
12:30 - 13:30

De novo virus design (ONLINE)temaaaa
Alfonso Jaramillo Rosales
Martes, 13 de Febrero de 2024

10:00 - 11:00

Sequence-based assignment of protein functional sitestemaaaa
Florencio Pazos Cabaleiro
11:15 - 12:15

Analysis of biological networks: a complex-network approachtemaaaa
Florencio Pazos Cabaleiro
Miércoles, 14 de Febrero de 2024

10:00 - 11:00

Bottom-up assembly of microbial ecosystem from metagenome datatemaaaa
Javier Tamames de la Huerta
11:15 - 12:15

Genome-Scale Metabolic Modelingtemaaaa
Juan Nogales Enrique
Jueves, 15 de Febrero de 2024

10:00 - 11:00

Bacterial computing (I)temaaaa

11:15 - 12:15

Bacterial computing (II)temaaaa

12:30 - 13:30

Visit CBGP-UPMtemaaaa

Jueves, 22 de Febrero de 2024

10:00 - 12:00

EXAM F2temaaaa

Jorge Barriuso Maicas
Lunes, 01 de Abril de 2024

12:30 - 13:30

Queueing: proteases and degradation as a tool in synthetictemaaaa


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